Digimon Xros Wars: Toki wo Kakeru Shounen Hunter-tachi ocorre um ano após a derrota de Bagramon e companhia.
Desde então, Taiki Kudou e Yuu Amano formaram um time de basquete com o colega de classe de Yuu, Tagiru Akashi.
Um dia, Tagiru descobre uma área estranha chamada DigiQuartz, um reino estranho e instável que existe entre os mundos humano e digital.
Ele então percebe que crianças de todo o mundo obtiveram Xros Loaders, bem como parceiros Digimon, para participar de uma competição chamada 'Digimon Hunt'.
Os Digimon que vagam do mundo digital para o DigiQuartz são capazes de se alimentar das emoções negativas que vazam do mundo humano.
Isto torna o Digimon mais forte ao custo de ser extremamente violento.
Como resultado, os Digimon Hunters devem trabalhar para impedir que estes Digimon causem estragos no mundo humano.
Acompanhado pelo problemático Gumdramon, Tagiru pretende se tornar o melhor caçador de Digimon, embora sem saber das conexões Digimon anteriores de Taiki e Yuu.
No entanto, uma força sinistra espreita com a criação do DigiQuartz, e os jovens caçadores logo perceberão que o Digimon Hunt é muito mais do que um simples jogo...
Esta sinopse foi traduzida automaticamente.
