Kotetsushin Jeeg se passa cinquenta anos após o original e apresenta um novo elenco de personagens - principalmente o novo personagem principal Kenji Kusanagi, um estudante do ensino médio que se torna Kotetsushin Jeeg para lutar contra o súbito reaparecimento de "Haniwa Genjin" ("Haniwa Phantom Gods", ou robôs de argila) do Império Jamada governado pela Rainha Himika.
Outros personagens incluem Tsubaki Tamashiro (neta de Miwa Uzuki);
e Kyou Misumi.
Outros personagens principais da série original também aparecem.
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