As Crianças Escolhidas estão em choque após a traição de Meicoomon, o monstro digital que recentemente se juntou ao grupo ao lado de sua parceira humana, Meiko Mochizuki.
Koushirou Izumi está determinado a diagnosticar a infecção que tomou o controle de Meicoomon.
Enquanto isso, Takeru Takaishi percebe que seu próprio parceiro, Patamon, está começando a apresentar sintomas alarmantes semelhantes aos de outros Digimon infectados, como Meicoomon.
Só então, as Crianças Escolhidas recebem uma mensagem da misteriosa entidade Homeostasis, que lhes informa que o seu mundo está em perigo de destruição total – e o Mundo Digital, o lar dos Digimon, também está.
A Homeostase planeja decretar uma “Reinicialização”, que redefinirá todos os dados que compõem o Mundo Digital e erradicará a infecção.
No entanto, o Reboot também apagará as memórias de todos os Digimon, incluindo os parceiros das Crianças.
As Crianças Escolhidas conseguirão parar Meicoomon antes que a reinicialização seja necessária, ou será este o fim do seu tempo junto com seus Digimon?
[Escrito por MAL Rewrite]
Esta sinopse foi traduzida automaticamente.