É o ano de 2004 DC, e o pandemônio irrompe quando uma misteriosa raça alienígena semelhante a um sapo enche o céu com OVNIs - ou assim sonha Fuyuki Hinata, de 12 anos.
Coincidentemente, o sargento Keroro, líder de um esquadrão preliminar para a invasão Keroniana de Pekopon - o nome alienígena da Terra - começa sua missão invadindo a casa de Fuyuki.
Depois de subjugar o menino e sua irmã, Keroro planeja se reunir com seus companheiros e retornar à nave-mãe para consertar seu inestimável dispositivo de invasão, o Kero Ball.
Infelizmente, ele recebe a notícia de que o quartel-general abandonou a recuperação de sua unidade devido a um problema sem precedentes que forçou o resto dos Keronianos a fugir.
Conseqüentemente, Keroro é forçado a ficar na residência de Hinata junto com o amigável e sonhador Fuyuki;
sua irmã atlética e temperamental, Natsumi;
e sua mãe trabalhadora e atraente, Aki.
Agora presos até novo aviso, Keroro e seu pelotão passam todos os dias planejando dominar o mundo, mas são sempre frustrados por vários fatores inesperados.
No entanto, à medida que vivem ao lado dos humanos, aprendem a tratá-los como amigos e aliados, formando ligações cómicas, mas significativas, que fazem valer a pena a sua vida na Terra.
[Escrito por MAL Rewrite]
Esta sinopse foi traduzida automaticamente.