No ano da Era Cósmica 0071, a colônia espacial Heliópolis permanece neutra na grande guerra que assola a galáxia entre os Coordenadores, seres humanos cujas características biológicas foram alteradas antes do nascimento, e os Naturais, pessoas inalteradas que permanecem no planeta Terra.
O profundo ódio dos Naturais pelos Coordenadores levou os seres avançados ao espaço, buscando abrigo em colônias artificiais.
Kira Yamato é um coordenador e estudante universitário em Heliópolis, quando sua vida fica em desordem quando a ZAFT, a organização militar composta por coordenadores rebeldes, ataca a colônia em um esforço para roubar um conjunto de cinco mobile suit militares de última geração conhecidos como Gundams.
Enquanto ZAFT consegue fugir com quatro dos mobile suit, Kira assume o controle do Gundam final, o Strike.
Sobrevivendo à batalha, Kira e seus amigos de faculdade se juntam à tripulação do Archangel, uma nave dirigida pela Aliança Terrestre, e os jovens soldados vivenciam os horrores da guerra e as perdas que a acompanham.
[Escrito por MAL Rewrite]
Esta sinopse foi traduzida automaticamente.