Após um hiato de um ano, Shinpachi Shimura retorna a Edo, apenas para se deparar com uma surpresa chocante: Gintoki e Kagura, seus colegas membros do Yorozuya, tornaram-se personagens completamente diferentes!
Fugindo confuso do quartel-general de Yorozuya, Shinpachi descobre que todos os habitantes de Edo passaram por mudanças impossivelmente extremas, tanto na aparência quanto na personalidade.
O mais inacreditável é que sua irmã Otae se casou com o chefe Shinsengumi e perseguidor desavergonhado Isao Kondou e está grávida de seu primeiro filho.
Perplexo, Shinpachi concorda em se juntar ao Shinsengumi a pedido de Otae e Kondou e descobre transformações ainda mais surpreendentes em andamento dentro e fora das fileiras da organização.
No entanto, descobrindo que o vice-chefe Toushirou Hijikata permaneceu inalterado, Shinpachi e seu improvável aliado Shinsengumi decidiram devolver a cidade de Edo ao que eles lembram.
Com ainda mais piadas sujas, paródias irônicas e referências descaradas, Gintama segue a equipe Yorozuya em mais desventuras no mundo vibrante e cheio de alienígenas de Edo.
[Escrito por MAL Rewrite]
Esta sinopse foi traduzida automaticamente.